Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Casc1Q6TDU8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms