Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptx4Q6RUU0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms