Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a1Q6PEM8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a1Q6PEM8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a1Q6PEM8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a1Q6PEM8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a1Q6PEM8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a1Q6PEM8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a1Q6PEM8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a1Q6PEM8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms