Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtifQ6PEE2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtifQ6PEE2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CtifQ6PEE2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtifQ6PEE2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtifQ6PEE2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtifQ6PEE2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtifQ6PEE2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtifQ6PEE2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtifQ6PEE2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtifQ6PEE2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtifQ6PEE2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtifQ6PEE2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtifQ6PEE2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms