Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms