Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI8

Cxxc4, CXXC-type zinc finger protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc4Q6NXI8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxxc4Q6NXI8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc4Q6NXI8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms