Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms