Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm5416Q6IE28 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gm5416Q6IE28 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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