Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pkp4Q68FH0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms