Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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