Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrhQ62361 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrhQ62361 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrhQ62361 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TrhQ62361 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrhQ62361 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrhQ62361 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrhQ62361 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrhQ62361 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms