Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms