Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Prm3Q62100 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms