Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dsg1aQ61495 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1aQ61495 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms