Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrkQ60976 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrkQ60976 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrkQ60976 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrkQ60976 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrkQ60976 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
JrkQ60976 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms