Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms