Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav6-2Q5R1I4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms