Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opa3Q505D7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms