Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

Predictions only

Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Herc2Q4U2R1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms