Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms