Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms