Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc114Q3UX62 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms