Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms