Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Znf48Q3US17 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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