Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcgf5Q3UK78 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcgf5Q3UK78 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcgf5Q3UK78 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcgf5Q3UK78 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcgf5Q3UK78 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms