Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Yipf3Q3UDR8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms