Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3U6N9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3U6N9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U6N9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U6N9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms