Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc174Q3U155 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms