Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3TTL0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTL0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTL0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTL0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTL0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms