Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3TTJ4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3TTJ4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms