Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc69Q3TCJ8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms