Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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