Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms