Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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