Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms