Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnma1Q08460 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnma1Q08460 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnma1Q08460 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnma1Q08460 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnma1Q08460 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnma1Q08460 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnma1Q08460 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnma1Q08460 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnma1Q08460 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcnma1Q08460 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms