Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms