Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms