Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox10Q04888 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox10Q04888 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms