Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax5Q02650 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax5Q02650 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax5Q02650 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax5Q02650 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax5Q02650 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax5Q02650 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax5Q02650 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax5Q02650 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax5Q02650 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax5Q02650 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax5Q02650 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax5Q02650 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax5Q02650 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax5Q02650 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax5Q02650 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax5Q02650 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax5Q02650 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax5Q02650 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax5Q02650 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax5Q02650 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax5Q02650 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax5Q02650 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax5Q02650 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax5Q02650 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax5Q02650 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax5Q02650 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax5Q02650 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax5Q02650 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax5Q02650 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax5Q02650 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax5Q02650 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax5Q02650 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax5Q02650 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax5Q02650 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pax5Q02650 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pax5Q02650 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax5Q02650 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax5Q02650 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax5Q02650 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax5Q02650 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax5Q02650 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax5Q02650 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax5Q02650 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax5Q02650 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax5Q02650 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax5Q02650 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pax5Q02650 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax5Q02650 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pax5Q02650 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax5Q02650 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax5Q02650 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax5Q02650 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax5Q02650 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax5Q02650 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax5Q02650 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax5Q02650 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax5Q02650 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pax5Q02650 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax5Q02650 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax5Q02650 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax5Q02650 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pax5Q02650 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms