Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms