Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms