Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms