Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms