Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhodP97348 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhodP97348 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhodP97348 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhodP97348 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhodP97348 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhodP97348 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhodP97348 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhodP97348 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhodP97348 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RhodP97348 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhodP97348 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhodP97348 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhodP97348 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhodP97348 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhodP97348 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhodP97348 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhodP97348 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RhodP97348 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhodP97348 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhodP97348 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhodP97348 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhodP97348 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhodP97348 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhodP97348 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhodP97348 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RhodP97348 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RhodP97348 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhodP97348 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhodP97348 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhodP97348 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhodP97348 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhodP97348 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhodP97348 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhodP97348 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhodP97348 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhodP97348 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhodP97348 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhodP97348 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhodP97348 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhodP97348 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhodP97348 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhodP97348 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhodP97348 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhodP97348 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhodP97348 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhodP97348 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhodP97348 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhodP97348 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms