Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms