Protein–RNA interactions for Protein: P84228

Hist1h3b, Histone H3.2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h3bP84228 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist1h3bP84228 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist1h3bP84228 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist1h3bP84228 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist1h3bP84228 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist1h3bP84228 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist1h3bP84228 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist1h3bP84228 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist1h3bP84228 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist1h3bP84228 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist1h3bP84228 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist1h3bP84228 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hist1h3bP84228 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms