Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cbx1P83917 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx1P83917 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms