Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubg1P83887 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms