Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf1P81269 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf1P81269 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf1P81269 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf1P81269 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf1P81269 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf1P81269 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms